Ühingus on 2025.a aprilli lõpu seisuga 305 liiget (vt graafikut), kellest 10 on ajutiselt liikmestaatuse peatanud. 40% liikmetest on ühingusse kuulunud 10 ja enam aastat. Ühingu liikmeskond on kasvanud 33% perioodil 2014-2025 (kasv 204-lt 305 liikmeni).
2020.a alguses tõi koroonapandeemia liikmeskonna mõningase languse, mida on näha ka allolevalt graafikult. Kuid 2021.a novembris hakkas liikmeskond taas kasvama ning 2021. aasta lõpuks jõudis liikmete arv tagasi koroona-eelsele 2019.a lõpu tasemele, mis oli siis läbi aegade suurim liikmete arv. 2023.aasta lõpus kasvas ühingu liikmeskond korraks 300 liikmeni, mis oli sel hetkel suurim liikmete arv ühingu ajaloos. 2024. aasta lõpuks saime kindlalt ja lõplikult kätte 300 liikme eesmärgi ja liigume edasi kasvu kursil.
Liikmete kaudu on ühingus esindatud üle 150 ettevõtte ja organisatsiooni, sh ministeeriumid, pangad, kindlustusseltsid, audiitorettevõtjad, riigi äriühingud. ESAÜ liikmetest üle 50% on erasektorist ning see näitaja kasvab. Avaliku ja kolmanda sektori osa selle võrra vaikselt väheneb.

Ühingul on asutaja-, tegev-, üliõpilas-, au- ning toetajaliikmed. Liikmed peavad vastama The Institute of Internal Auditors ( IIA) nõuetele:
- kõik ühingu liikmed peavad olema IIA liikmed;
- Certified Internal Auditor (CIA) kutsetunnistuse omanikud on automaatselt ühingu liikmelisuse nõuetele vastavad;
- ühingu liikmeks saamist ei tohi takistada isiku sugu, usuline kuuluvus, seksuaalne orientatsioon, rass, rahvus või muu asjaolu, mis ei ole seotud isiku kompetentsi või iseloomuga, välja arvatud need asjaolud, mis on kehtestatud Eesti õigusaktidega.